La COALICO cuenta con una Asamblea compuesta por todas las organizaciones parte, un Comité Ejecutivo y una Secretaría Técnica. Por tratarse de un espacio de confluencia de organizaciones, la COALICO no cuenta con personería jurídica, por ello su representación legal está en cabeza de la Asociación Cristiana Menonita para Justicia, Paz y Acción Noviolenta (Justapaz), organización parte.
La Asamblea
La COALICO, como espacio de coordinación de organizaciones de la sociedad civil que trabajan en el campo de los derechos de la niñez, está conformada actualmente por siete organizaciones.
Cada organización tiene el compromiso de delegar una persona para la representación en la COALICO la cual participa en las asambleas y reuniones de comités, ejecuta las actividades acordadas en el plan operativo anual.
Esta persona debe destinar al menos un día y medio de trabajo semanal a las actividades de la plataforma. La presencia regional de las organizaciones facilita la ejecución de actividades en los ámbitos regionales. Regularmente los equipos en terreno apoyan las actividades o las lideran o se aprovechan viajes periódicos de los equipos de Bogotá para articular las actividades de COALICO.
Comité Ejecutivo
En cuanto a los aspectos administrativos, de ejecución presupuestal y manejo del equipo de trabajo, el órgano encargado es el Comité ejecutivo, el cual realiza reuniones periódicas con la coordinación de la ST para hacer seguimiento a la ejecución de los proyectos.
En el presupuesto de la propuesta se prevé un rubro destinado al cubrimiento de los gastos administrativos, lo cual se justifica teniendo en cuenta que la COALICO es administrada por Justapaz y el manejo de cualquier ingreso de recursos para este espacio, genera gastos correspondientes al proceso de administración delegada, la generación de los informes financieros requeridos en la ejecución de los contratos que se suscriben en representación de la COALICO, con lo cual se cubren gastos como: contabilidad, generación de reportes, gastos bancarios y control y aprobación de los gastos de las actividades previstas.
Secretaría Técnica
Para facilitar la coordinación, comunicación y funcionamiento de la COALICO, existe una Secretaría Técnica, la cual es el órgano dinamizador de las apuestas políticas y compromisos asumidos por la plataforma, quien a su vez, cuenta con una persona en la Coordinación y un equipo para las tres líneas estratégicas de la COALICO: Fortalecimiento de Capacidades Locales, Investigación y Monitoreo, Incidencia Política y de Comunicaciones, y además, de Administración y Proyectos.